Foi Ministro da Presidência no XVII e no XVIII Governos Constitucionais (2005-2011), com a tutela da Presidência do Conselho de Ministros e funções de coordenação do processo legislativo do Governo, bem como de porta-voz do Conselho de Ministros.

Para além do apoio ao Primeiro-Ministro na coordenação política do Governo e na preparação dos debates parlamentares, teve ainda sob a sua tutela:

• A política de integração dos imigrantes, o Alto Comissariado para a Imigração e o Diálogo Intercultural (ACIDI) e o Programa Escolhas;

• A política para a igualdade de género e a Comissão para a Igualdade de Género (CIG);

• A política para a modernização administrativa (incluindo o Programa Simplex, as Lojas do Cidadão, o Programa Legislar Melhor) e a Agência para a Modernização Administrativa (AMA);

• A política de juventude e o Instituto Português da Juventude, a Cooperativa Movijovem e a Fundação para as Tecnologias da Informação (FDTI);

• A política para o desporto e o Instituto do Desporto de Portugal;

• A política estatística nacional e o Instituto Nacional de Estatística;

• A relação com as Regiões Autónomas e a política para as autarquias locais, a Direcção-Geral das Autarquias Locais e a Inspeção-Geral das Autarquias Locais (IGAL);

• O projeto Frente Tejo (incluindo a requalificação do Terreiro do Paço) e a Sociedade Frente Tejo;

• A relação com a Igreja Católica e a regulamentação da Concordata;

• As comemorações do Centenário da República em 2010-2011, a respetiva Comissão Nacional e o respetivo Conselho Consultivo.

No exercício das suas funções, foi coadjuvado pelos seguintes Secretários de Estado: 

• Presidência do Conselho de Ministros: Jorge Lacão (2005-2009) e João Tiago Silveira (2009-2011);

• Igualdade: Elza Pais (2009-2011);

• Juventude e Desporto: Laurentino Dias (2005-2011);

• Modernização Administrativa: Maria Manuel Leitão Marques (2009-2011);

• Administração Local: José Junqueiro (2009-2011).

Foi ainda coadjuvado, sucessivamente, pelos seguintes Altos-Comissários para a Imigração e o Diálogo Intercultural: Pe. António Vaz Pinto, Rui Marques e Rosário Farmhouse.